靛蓝干燥主要分为原粉靛蓝干燥和商品靛蓝干燥。一般情况下，用于出口的靛蓝多为原粉。
原粉干燥方法主要是合成后的靛蓝，经压滤机压滤后，以滤饼状态进入干燥机。目前，我国用于原粉靛蓝干燥的干燥机多为耙式干燥机、桨叶干燥机、旋转快速干燥机等。在这三种机型中，前两种干燥机传热方式属于传导传热为主，后一种属于对流传热。按生产方式分，耙式干燥机为间歇式干燥，桨叶干燥机、旋转快速干燥机为连续式干燥。
当生产规模较小时，应采用耙式干燥机进行干燥；生产规模较大时，应采用桨叶干燥机、旋转快速干燥机等连续式干燥机进行干燥处理。这是因为，桨叶干燥机、旋转快速干燥机一次性投资较高，达不到一定规模时不经济。当产量较大时，采用这两种机型，虽然投资较高，但生产效率高，工作环境好，劳动强度小，生产过程容易实现自动化，且产品含水量均匀。另外，不能忽视的一个问题是，靛蓝因相对密度很小（在200千克／立方米左右），很容易被干燥气体所夹带。在这三种干燥机中，按夹带量的多少顺序排列为：旋转快速干燥机、桨叶干燥机、耙式干燥机。因此，选用这几种干燥机时，配备气体过滤设备的规模是不同的。特别是以采用对流传热为主的旋转快速干燥机时，因靛蓝的粒子可以达到0．2微米左右，气固分离的过程更为重要，要求除尘器的过滤面积更大，对过滤材料的效率要求更高。
生产商品靛蓝则需选用喷雾干燥机。因商品靛蓝的生产需要进行预处理，以达到相同的标准强度。标准化过程处理是指在加入多种助剂后，在液体状态下进行高速打浆，原料是可流动的液体，含固量为25％～30％，所以需经喷雾干燥以获得粉状或颗粒状产品。如采用压力式喷雾干燥机进行干燥处理，产品粒度可保持在80～180目之间。靛蓝是一种比较耐热的染料，干燥热空气进口温度可以在230℃～240℃之间。
